Você pode registrar o quanto o cliente usa o serviço e fazer a cobrança ao final do período de assinatura com o Faturamento por consumo.
É útil quando você quer cobrar um valor proporcional dos clientes conforme o consumo do serviço durante o ciclo de faturamento em vez de usar valores fixos. Se você tem um serviço de SaaS (software como serviço) de e-mail corporativo, por exemplo, é possível contabilizar as chamadas da API do cliente e cobrar pelo total usado ao final do mês.
Faturamento baseado no uso com assinaturas (documentação da Stripe)